本法人には、法人の管理、運営に係る総合的職務を行う法人本部を置き、理事長が所管する。法人本部は、事務部、研究開発事業部、事業支援部から構成され、法人の目的を達成するための事務処理、研究活動、渉外業務を担当する。

事務部は総務係、財務係で構成し、次の業務を担当する。

・運営委員会等の各種委員会、及び会議に関すること
・職員の採用・給与・福利厚生に関すること
・ホームページ、情報の開示及び閲覧に関すること
・物品の調達に関すること
・その他総務に関すること

・予算決算に関すること
・資産の管理運用に関すること
・その他財務に関すること

・特許、技術情報、共同研究、試作に関する窓口業務
・理事長、研究開発事業部、事務部間の連絡調整及び連絡会議の運営
・事業計画、事業報告の取りまとめ
・知的財産の取得、維持管理、運用
・共同研究等及び外部資金の受入れに関する調整
・試作・提供材料に関する管理業務
・物品の検収に関する業務
・安全衛生環境、機密情報管理、コンプライアンスに関する業務